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प्रोटीन Z की डोमेन संरचना, जो 180 अमीनो एसिड से बनी है, नीचे दिए गए चित्र के ऊपरी भाग में दिखाई गई है। प्रोटीन Z को बॉक्स में दिखाए गए तंत्र के माध्यम से एक सिस्टीन अवशेष (तीसरा अमीनो एसिड) में पामिटॉयलेट किया जाता है।
निम्नलिखित में से कौन सा आरेख प्लाज्मा झिल्ली में प्रोटीन Z की सही टोपोलॉजी को दर्शाता है?
मुझे लगता है कि दूसरा आरेख सही है क्योंकि साइटोप्लाज्मिक पक्ष में पर्यावरण को कम करने वाला है और इसलिए एसएच को इस तरह प्रतिक्रिया करने की अनुमति नहीं दी जाएगी। क्या मैं सही हूँ ?
मुझे नहीं लगता कि इस प्रतिक्रिया में कोई ऑक्सीकरण या कमी हो रही है; निश्चित रूप से एनएडीएच कॉफ़ेक्टर या ऐसा कुछ भी शुद्ध कमी या भागीदारी नहीं है। इसके अलावा, मुझे लगता है कि यह कल्पना करना बहुत कठिन नहीं है (esp। चूंकि ये एंजाइम-उत्प्रेरित प्रतिक्रियाएं हैं) यह कल्पना करना कि तंत्र सरल है: सिस्टीन द्वारा थियोस्टर के कार्बन का न्यूक्लियोफिलिक हमला, एक थियोकेटल मध्यवर्ती बनाता है, जिसके परिणामस्वरूप बेदखल हो जाता है CoASH एक छोड़ने वाले समूह के रूप में। कोई कमी या ऑक्सीकरण नहीं।
ऑक्सीकरण या कमी के बजाय, मैं इस बारे में सोचूंगा कि वास्तव में प्रत्येक प्रतिक्रिया के घटक कहां मौजूद हैं। पामिटॉयलेशन प्रतिक्रिया होने के लिए, आपको चाहिए: प्रोटीन जेड एन टर्मिनस, पामिटॉयल-सीओए, और प्रोटीन एसाइलट्रांसफेरेज़। कोशिका के अंदर या बाहर इन घटकों के मौजूद होने की अधिक संभावना कहाँ है? विशेष रूप से यह देखते हुए कि CoASH में कई नकारात्मक चार्ज किए गए फॉस्फेट समूह हैं।